בשנת 2008 החליטה רל"א להפעיל את המרפאה הניידת גם ברצועת עזה, בעיקר עקב התדרדרות זמינות ואיכות השירותים הרפואיים המצויים ברצועה, במקביל לירידה דראסטית במספר החולים המורשים לצאת את הרצועה ולקבל טיפול במרכזים הרפואיים הפלסטינים המתקדמים יותר בגדה המערבית וירושלים המזרחית או בחו"ל.

קיום המשלחות הרפואיות לרצועת עזה עונה על מספר צרכים:

• המומחים הרפואיים הלוקחים חלק במרפאה מעניקים לחולים טיפול שאין בנמצא, וחוסכים להם את הצורך במסע הבירוקראטי המפרך להשגת היתר יציאה.
• צוותי הרפואה הפלסטינים – שגם הם כלואים ברצועה וכבר כמה שנים לא הורשו לצאת לכנסים רפואיים או השתלמויות – נחשפים ולו במעט לטכנולוגיות וידע חיוני חדש.
• רופאים לזכויות אדם יכולה באמצעות אותן משלחות לעמוד על מצב שירותי הבריאות ברצועת עזה, להיות בקשר ישיר עם חלק מהחולים הפונים אלינו לעזרה כאשר נמנעת יציאתם מהרצועה, וכן להביא לציבור הישראלי עדות בגוף ראשון באשר למחיר שמשלמת האוכלוסייה האזרחית והקהילה הרפואית הפלסטינית עקב הסגר הממושך.

כניסתן של המשלחות אינה דבר של מה בכך - פעמים רבות בקשתנו לכניסה מסורבת אם על ידי הצבא, ואם על ידי השב"כ ולעיתים אנו מקבלים את האישור רק בבוקרו של יום. מתן ההיתר או הסירוב בלילה שלפני יציאת המשלחת או אפילו בבוקר אותו היום מקשה על קיומן של המשלחות. רופאים שביטלו משמרות מתקשים לתאם מועד חדש שבו יוכלו להשתחרר מימי עבודה בבתי החולים או מהמרפאות בהם הם עובדים. החולים – חלקם ממתינים בצום – מתוסכלים ואינם יודעים אם ומתי יטופלו.

פעילות לאורך כביש 443 
 
בתחילת 2009 הסתיימה פעילות בת שנה של המרפאה הניידת ומרפאת הנשים בכפרים הממוקמים דרומית מערבית לרמאללה לאורך כביש ההפרדה, הוא כביש 443. כידוע, מאז 2002 חסום הכביש (בחלקו הנמצא בגדה המערבית) לתנועת פלסטינים ברכב או ברגל והשימוש בו אסור אפילו במקרים רפואיים דחופים. האיסור על תנועת פלסטינים בכביש 443 פוגע פגיעה חמורה בחופש התנועה וביכולת של התושבים הפלסטינים לממש את הזכות לבריאות. לפיכך בחרה המרפאה הניידת להתמקד בארבעה כפרים; חרבת´ה, בית עור אלתחתא, בית סירא וניעלין, אל כל אחד מהם חזרה המרפאה שלוש פעמים. כפרים אלה נבחרו בשל היותם כפרי שוליים קטנים, מבודדים, חסרים שירותים רפואיים ומוקפים במחסומים. ביקורי המרפאה הניידת בכפרים אלה נעשו תוך התגברות על מחסומי עפר או בטון כאשר צוות המרפאה, על ציודה ובית המרקחת הנייד שלה, עובר את המחסומים רגלית.